El Sistema de Gestión de la I+D+i, conforme a la norma UNE 166002, está implantado en EMASESA desde el año 2009. Actualmente, el alcance del certificado engloba las actividades de:
- Tecnología del Medio Ambiente.
- Tecnología de la Construcción: Ingeniería hidráulica, alcantarillado y depuración de aguas y abastecimiento de aguas.
- Hidrología: Calidad del agua, limnología y aguas superficiales.
- Metrología.
- Tecnología de las Telecomunicaciones.
- Sistemas de información; diseño y componentes.